pq和mqb都是非对称加密算法，但是两者的应用场景不同。pq算法主要是针对传统的RSA算法在量子计算机时代下的安全性问题而提出的，主要应用于数字签名和密钥交换等领域。

而mqb算法则是基于格的加密算法，主要应用于保护通信中的机密信息，如保护数据传输、保护云计算和物联网等。因此，两者在应用场景和安全性方面有所不同，具体选择哪个算法还需要根据不同的实际需求来确定。