南方自建房允许盖好几层的原因可能有以下几点：

1. **气候因素**：南方地区气候潮湿，尤其是梅雨季节，一层容易受潮，居住舒适度较低。因此，建造多层房屋可以使上层空间更加干燥舒适，适合居住。

2. **储存空间**：随着生活水平的提高，家庭需要更多的储存空间来放置物品。多层建筑可以提供更多的储物空间，满足家庭的使用需求。

3. **社会心理**：在一些地区，由于攀比心理，人们倾向于模仿邻居建造相似的房屋，这也是促使一些家庭建造多层房屋的原因之一。

4. **政策规定**：不同地区对于农村自建房的高度和层数有不同的限制。一些地方可能允许建造三层或更高的房屋，但通常都会有明确的建筑规范和安全要求。

5. **结构安全**：在考虑增加楼层时，必须确保建筑的结构安全。如果是砖混结构，可能需要加固地基和结构，以承受额外的重量和确保建筑的稳定性。

6. **审批手续**：在加盖楼层之前，需要办理相应的审批手续，确保建设合法合规。这些手续可能包括向当地住建局申请、获取审批文书等。

综上所述，南方自建房允许建造多层的原因是多方面的，包括气候适宜、增加储存空间、社会心理以及政策规定等。在建造多层房屋时，房主需要遵守当地的建筑规范和安全标准，并办理相应的审批手续。