是的，衡水市自来水是南水北调工程的一部分。南水北调工程是一项国家重点工程，旨在解决中国北方地区严重的水资源短缺问题。该工程由南方的长江、黄河等水源通过输水管道将水引到北方，包括河北省的衡水市。因此，衡水市自来水的源头就是来自南方的水源，并且南水北调的完成极大地缓解了北方地区的水资源紧张问题，对于当地人民的生活、工业、农业等方面都有着重要的意义。