是的，EXE加密文件在电脑重装后注册码会发生变化。这是因为EXE格式的视频文件通常是用屏幕录像专家录制并加密的视频文件，它的注册码是由系统生成的，与系统信息相关联。如果更换了系统，那么注册码也会随之改变。因此，如果需要重新使用这种加密文件，需要与销售方联系，根据新系统生成的ID重新获取注册码。