从大学排名的角度对比，东南大学要比合肥工业大学更好一些。

从综合实力上来讲，东南大学是中央直管，教育部直属的副部级985全国重点大学，又是双一流，合肥工业大学是211工程大学，两所大学的综合实力还是存在一定的差距，东南大学要优于合肥工业大学。