农村土地确权证可以在农商行办理贷款，并且金额会有所差别。

这是因为农村土地确权证有助于证明农户的土地使用权，可以增强信贷风险管理的能力，因此农商行会在办理贷款时将其作为一项重要的考虑因素之一。

然而，具体的贷款金额还是需要根据农户的具体情况、土地面积和质量、经营水平和市场情况等因素进行评估确定，因此无法给出明确的数值。