1、两者的性质不同，撤职是行政处分，而免职是法定的人事处理种类，无惩戒性质。

2、两者的条件不同，针对违法记录情节较为严重导致国家和人民利益造成重大损失或后果的公务人员，可给予撤职;

而免职处理可以是免去现任职务，或者是职务自行免去。

3、两者导致的后果不同，撤职导致的影响有：

降低一级以上职务，并按新任职务确任对应的级别和工资;