要判断水底淤泥的厚度，可以采用以下几种方法：

推测法：通过观察水体中的底泥颜色和浑浊程度，以及水下物体的可见程度，可以推测出底泥的厚度。这种方法适用于水体较浅且底泥较浅的情况，但由于主观因素的影响较大，推测结果可能存在一定的误差。

深度测量法：使用深度测量仪器，如深度计或声纳测深仪，可以直接测量水体中的底泥厚度。这种方法的优点是测量结果准确可靠，但需要一定的仪器设备和专业知识。

取样法：在水底进行取样，然后对取样进行分析，可以得出底泥的厚度。常用的取样方法有沉积物岩芯取样法和沉积物表层取样法。

遥感法：使用遥感技术，如卫星遥感或无人机遥感，获取水体表面的影像信息，进而推测出底泥的厚度。

此外，还可以使用超声波泥位计、光学法污泥界面仪、污泥浓度计、电容式界面仪、电磁波界面仪、测杆法、超声波测量等具体设备或技术来判断淤泥的厚度。

总之，选择哪种方法取决于具体的环境和条件，以及所需的精确度和成本等因素。在实际操作中，可以根据具体情况选择合适的方法或结合多种方法进行综合判断。