存储卡里的APP运行缓存是保存在手机内存中的，而不是存储卡里。运行APP需要读取和处理大量数据，缓存的存在可以减少系统IO操作，提高APP的运行速度。

即使用户清空了APP缓存，APP可以重新生成缓存，但这也会占用一定的手机内存空间。

因此，建议定期清理不必要的APP缓存，并保留一部分适当的缓存空间，以保证APP的运行流畅。