安装马自达6的变速箱时，确实需要注意一些重要事项。首先，确保在装配前检查所有部件是否符合规定要求，并清除任何毛刺或杂物。其次，操作应在无尘的环境中进行，这样可以避免灰尘和杂质进入变速箱内部。在拆卸过程中，要遵循正确的顺序，一般是先拆卸变速器盖，然后是第二轴、中间轴和倒挡轴。
同时，如果使用的是旧齿轮，应尽量保持其原有的磨合关系。当齿轮间隙超过一定范围时，应考虑更换新齿轮，并确保更换后的齿轮间隙符合规定。另外，装配前对所有零件进行彻底清洗是非常重要的，可以使用压缩空气或干净的布来清除油污和杂质。
最后，在装配完成后，务必进行试运转，确保各挡位能灵活转动，无渗油、漏油和卡涩现象。换挡过程应轻便自如，且不应有不正常响声或过热现象。