全程登记和半程登记是两种不同的登记方式，它们的主要区别在于提交方式和电子签名对象。

全程登记（无纸全程电子化）的提交方式是网上申报材料预审通过后，由签字人网上在线完成电子签名，无需提交纸质书式材料，电子档案替代纸质档案。而半程登记（网上登记系统）的提交方式是对网上预审通过材料进行打印、签字、盖章确认，并将纸质书式材料提交预审登记机关。

此外，全程登记的电子签名对象包含企业投资人、董监事、经理、秘书、证券事务代表等人员信息，而半程登记的电子签名对象主要是公司发起人或股东、法定代表人、负责人或实际控制人。

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