两只异瞳猫交配，有可能会生出异瞳猫也有可能不会，这取决于父母的基因。异瞳猫的瞳孔颜色不同，是由于一只眼睛的色素沉着不均匀所致，是一种天然的突变现象，因此繁殖出异瞳猫并不一定稳定。如果这两只异瞳猫是同色系的，则生出同色系的异瞳猫可能性较大；如果两只异瞳猫每只眼睛的颜色都不同，则后代产生异瞳猫的机率就更小。总之，父母的基因和随机因素都会影响后代的颜色和特征，生出异瞳猫并不是一定的结果，需要进行基因检测和饲养细心才能保证繁殖出健康的猫咪。