北京公租房的租金缴纳频率并没有固定的规定，但一般是在首期入住时间后交纳满3个月的房租，并建立好扣租账户以后，就可以自由选择按月、按季度或者按年来交纳房租。也就是说，公租房的租金的支付周期可以是每月一次，也可以是季度一次或年度一次。