从香港带5000的东西回来的东西被海关扣，可以按照以下步骤处理：

及时联系报关行：货物被扣后，海关通常会发通知。要仔细看清通知的内容，注意问题出在哪里，然后及时通知报关行。

准确回复海关，并提供充足证据：海关在下达通知后会给一定时间来准备要提供的文件材料等，要在通知规定的时间内回复。如果想要自己回复信件给海关，要在报关行的配合下，把这些资料通过报关行发给海关。

执行海关的处理决定：因申报货值太低扣关，补交关税后从海关拿货出来；手续不全的货物扣关，比如个人进口，海关要求有进口权，找有进口权的公司代理清关；如果是需要相关认证手续的，尽早补办尽早提供，但提供不了的话就无法清关；可以向海关申请货物退运，按国际惯例，清关不了的货物可以申请退运回发货地或是第三方贸易港口。