住院花了15000新农村合作医疗二档能报9000元。新农合报销多少取决于定点医疗机构的等级。规定如下：二级定点医疗机构5000元以下的部分按50%的比例报销，5000元至10000元的部分按55%的比例报销，10000元以上的部分按60%的比例报销。