名侦探柯南最悬疑的案件有以下几个：（排名不分先后）

1.第8集 美术馆杀人事件

本集因为被害人是被剑整个钉在了墙上，靠墙悬挂着。死状看上去十分恐怖，但是不仔细看还是看不出来的，因为你可以把屏幕亮度调低！

2.第11集 钢琴协奏曲《月光》杀人事件

本集是1小时特别篇，讲述了在十年前，有一位叫做麻生圭二的钢琴家被烧死在大火之中。在十年后，麻生圭二的童年伙伴全都死于非命，当这些伙伴死亡的时候案发现场都会响起贝多芬钢琴曲《月光》，于是这首曲子成为了整个案件的核心所在。

看过柯南的人应该都知道，这一集的凶手是麻生诚实，麻生诚实是男扮女装，目的是为了查找父亲的死因。在杀死第一个害死父亲的凶手之后，麻生诚实彻底变成了魔鬼。最终在帮父亲报仇之后，选择了结束生命去陪伴父亲。

推理出整个案件的柯南在第58集的时候十分懊悔自己将麻生诚实逼入绝境。

3.第20集 鬼屋杀人事件

本集主要得益于里面的小美女步美了。步美发现了鬼屋，于是邀请柯南、光彦、元太一起去探险，途中遇上了一起杀人案，案件的主要情节是儿子将父亲误杀。母亲因为疼爱儿子不愿意让儿子自首，于是就把屋子设计成了鬼屋。不得不说，里面的儿子和母亲披头散发的样子真的是挺吓人的。