两个亿的居间费可以通过多种方式入账，具体取决于合同条款和双方协商。

一种常见的方式是将费用划入中介公司的账户，然后交纳所需的税费，将剩余的金额转账给中介公司。另外，居间费也可以通过授予股权、提供其他金融服务或赠送优惠券等形式入账。无论如何，必须确保居间费的入账和交易的合法性和透明度，以避免潜在的法律风险。