如果工商营业执照持有人更换了手机号码，需要及时向工商行政管理部门办理变更手续，并进行营业执照注销和重新登记。

具体操作步骤如下：

1. 提交申请变更：持营业执照、企业法人身份证等相关证件，到工商行政管理部门提交申请变更。

2. 补充材料：根据当地工商行政管理部门的要求，补充变更相关材料，如身份证明、企业法人及负责人身份证明、变更申请表等。

3. 审批核准：申请提交后，工商行政管理部门会对材料进行审批核准。

4. 注销原执照：核准通过后，工商行政管理部门将注销原有的营业执照。

5. 重新登记：完成注销后，重新进行营业执照登记，并在新的执照上添加企业的新联系电话。

需要注意，更换手机号码是一项重大的工商变更事项，应当严格按照规定和标准操作。否则，可能会导致营业执照无法通过审核或被注销。