是的，如果你要通过机要通道寄送档案，通常需要对方单位出具证明。这是因为机要通道主要用于寄送机密文件，需要确保文件的安全性和保密性。

具体来说，你需要联系对方单位，向他们说明需要寄送档案的情况，并请求他们出具一份证明。证明中需要明确说明文件的性质、用途和寄送的目的，以便对方单位了解情况并判断是否可以提供帮助。

请注意，每个单位的规定可能有所不同，具体要求可能会因情况而异。因此，最好在寄送前先与对方单位进行沟通，确保了解所有必要的程序和要求。

希望这些信息对你有所帮助！如有其他问题或需要进一步的解释，请随时告诉我。