龙眼颜色变深并不一定代表坏了，颜色变深可能是由于龙眼果肉中的酚类化合物氧化反应而引起的，这样的变化也不一定影响其口感和品质。

但是如果龙眼颜色变深后出现了异味，就意味着该果实可能已经坏了。此外，如果龙眼表面出现裂纹或者有软烂的迹象，也代表着果实已经变质了。在购买和食用龙眼时，需要认真观察外表和气味，尽量选择外表光亮、色泽均匀、无划痕并且没有异味的龙眼果实。