包装40厘米高的棉花娃娃，纸箱大小需考虑娃娃体积以及保护缓冲的空间。一般而言，建议选用适当尺寸的箱子，比如长宽可增加10-20厘米以便放入并填充防震材料，高度则酌情增加至少10厘米。具体还需根据娃娃形状及包装要求调整，确保安全运输。简言之，约50*50*50厘米或以上规格纸箱可能合适。