连南马拉松赛道总长42.195公里，从连城市区出发，通过翔云大道、迎宾大道、南靖县沙河镇、尚干镇、金井乡等地，全程沿海风光如画，汇聚了福建东南沿海的特色美景。

其中最具挑战性的是途经翠屏山脉的连南山岭，路段长达7公里，最高处海拔约391米。同时还有一些具有鲜明特色的景观，如南靖县的土楼群、尚干古建筑、金井草胡、天池和水晶石等。整个赛道道路平坦、交通便利，为广大跑友提供了一个难得的挑战机会。