剧情梳理如下：

1、荆轲刺秦失败身亡，天下第一剑客盖聂受荆轲所托，护送荆轲之子荆天明躲避秦始皇追杀，在秦国边境残月谷，盖聂一人击退三百秦国铁骑，秦始皇震怒，命丞相李斯铲除两人。

2、李斯在阴阳家东皇太一的指引下寻访到盖聂的同门兄弟卫庄，卫庄为夺得天下第一剑的名号，答应李斯的要求，殊不知已掉入东皇太一的圈套。

3、原来天明在出生之时，身上被阴阳家偷偷种下"乾元玉煞"，"乾元玉煞"关系到一个巨大阴谋。

4、逃亡路上，盖聂与天明结识墨家众高手等人，一行人在命运的引领下进入被誉为世间最后一片净土的墨家机关城，而为了攻破机关城，秦始皇派出庞大的精锐之师，卫庄找到公输家族的掌门公输仇，机关城严密的防守工事受到前所未有的挑战。