如果工行收款码商户档案异常，需要联系工行相关客服进行沟通，提供相关资料和证明，例如商户的营业执照、身份证等等，以便工行能够核实并及时修正档案。此外，商户也需注意保证自身信息的真实性和合法性，以免出现档案异常等问题。