1. 处理器：苹果6s采用了更新更快的苹果A9处理器，而苹果6是A8处理器。苹果6s的运行内存为2GB，苹果6的运行内存只有1GB。
2. 外观：苹果6s的机身厚度比苹果6厚了0.2mm，重了14g。
3. 相机：苹果6s的摄像头升级为前置500万和后置1200万像素，相比苹果6内置的前置120万和后置800万像素摄像头，摄像头规格提升明显。苹果6相机没有光学防抖功能，但是在苹果6中相机已经加入了光学防抖功能。
4. 性能：苹果6s搭载全新苹果A9双核处理器，2GB内存，性能相比搭载苹果A8处理器，1GB内存的苹果6提升超过70%，并且功耗还更低。
5. 电池容量和待机时间：苹果6的电池容量是2915mA，而6s的电池容量是2910mAh。苹果6的理论待机时间为250小时，而6s待机时间更加的长是384小时。