要起诉12123营运损失费，需要按照以下流程进行:首先，要向有关当局提交申述并告知12123营运损失费的具体情况。

其次，可以委托律师起诉12123营运损失费，或者自行到法院办理起诉手续。最后，在法庭上提供证据和证言，以坚定自己的主张。