你好，如果您的淘宝店铺已经缴纳了3000元保证金，但是想要退还保证金，可以按照以下步骤操作：

1. 登录淘宝卖家中心，在“我的淘宝”页面中找到“店铺管理”选项。

2. 点击“店铺管理”后，找到“保证金管理”选项。

3. 在“保证金管理”页面中，点击“保证金退款”按钮。

4. 输入退款金额、支付密码等信息，点击“提交退款申请”。

5. 等待淘宝审核，审核通过后会将退款金额打入您的支付宝账户中。

需要注意的是，淘宝会对卖家进行一定的审核，确保卖家已经满足了所有的退款条件。如果您的店铺存在违规行为或者未完成交易等问题，可能会导致退款申请被拒绝。